Вакцина на основе вычислительных эпитопов против вируса мочевины греха. Иммуноинформатика Предсказание и моделирование коктейля эпитопов В- и Т-клеток из гликопротеина и нуклеокапсида

      Аннотация: Вирус Sin Numbre является патогеном категории А с уровнем смертности от 30% до 50%. Он стал причиной вспышки заболевания в Йосемитском национальном парке в 2012 году. До настоящего времени специфическая терапия для лечения HCPS, вызванного вирусом SNV, недоступна. Несмотря на многочисленные усилия по разработке безопасных и эффективных вакцин против SNV, включая традиционные, а также молекулярные подходы к вакцинам, на сегодняшний день нет ни одной вакцины, доказавшей свою высокую эффективность против SNV. В нашем исследовании мы проанализировали гликопротеин оболочки и нуклеокапсид SNV с помощью иммуноинформационных средств, размещенных в ресурсах IEDB, с целью определения наиболее консервативных и иммуногенных эпитопов для В- и Т-клеток. Затем предсказанные эпитопы оценивали по охвату населения в отношении всей популяции мира с ограниченными аллелями MHC-I и MHC-II. Среди предсказанных эпитопов для В-клеток лучшими кандидатами на гликопротеин и нуклокапсид были эпитоп 743CKKYAYPWQT752 и эпитоп 271QVDESKVS278, соответственно.

Ключевые слова: Иммуноинформатика, предикация, вирус мочевины греха, вакцины на основе эпитопов, инструменты силико, база данных иммунных эпитопов.